Międzynarodowy zespół badaczy z Cornell University i the Beyonce Thomson Institute for Plant Research (BTI) otrzymał z amerykańskiej National Science Foundation grant w wysokości 1,8 mln. dolarów na “International Tomato Sequencing Project” - kontynuację prac nad zsekwencjonowaniem genomu pomidora oraz opracowaniem bazy danych zawierających sekwencje genowe i informacje o pomidorach i roślinach pokrewnych. Łącznie od 2004 roku badacze otrzymali na projekt 5,8 mln. dolarów.
Poznanie sekwencji genomu pomidora pozwoli odpowiedzieć na pytania takie jak: jaka jest funkcja specyficznych genów rośliny? Czy udomowienie rośliny miało wpływ na zmiany genetyczne? Jakie rośliny w obrębie rodziny Solanaceae, do której należy pomidor, byłyby dobrymi kandydatami do modyfikacji przy pomocy inżynierii genetycznej? Baza danych będzie zawierała m. in. mapy genetyczne, bioblioteki DNA, markery DNA i informacje pozwalające porównywać sekwencje między różnymi gatunkami.
W projekt sekwencjonowania 12 chromosomów pomidora zaangażowani są naukowcy z dziesięciu krajów: Chin, Indii, Francji, Włoch, Hiszpanii, Korei Południowej, Japonii, Holandii i Wielkiej Brytanii, którzy zsekwencjonują po jednym chromosomie, oraz z USA, którzy rozszyfrują trzy chromosomy.
***
Holenderska firma chemiczna DSM zakończyła sekwencjonowanie genomu grzyba Aspergillus niger CBS 513.88, który DSM wykorzystuje do produkcji enzymów i innych substancji. Wyniki pracy 29 różnych instytucji publikuje “Nature Biotechnology“.
A. niger ma ok. 33,9 mln. par zasad i ponad 14 tys. genów. Do odkrycia pozostały jeszcze funkcje ok. 6500 tych genów. Dzięki projektowi firma DSM złożyła wnioski na wiele patentów dotyczących enzymów kodowanych przez DNA A. niger. Projekt pozwolił również nawiązać współpracę z wieloma innymi firmami, jak Gene Alliance, Biomax, Affymetrix.
hlbiotech
źródło: CheckBiotech.org, Genome Web
———————————
Oryginalna publikacja: Herman J Pel et al., “Genome sequencing and analysis of the versatile cell factory Aspergillus niger CBS 513.88″, Nature Biotechnology 25, 221 - 231 (01 Feb 2007) Research
