Naukowcy z USA opracowali innowacyjną metodę pozwalającą wydzielić z ludzkiej śliny i zbadać wszystkie białka - i to nie tylko te rozpuszczalne - donosi czasopismo “Molecular And Cellular Proteomics“.
Ślina posiada bogaty zasób białek różnej maści, które można wykorzystać do skriningu pod kątem obecności chorób jamy ustnej, a w szczególności nowotworów. Do tej pory jednak badacze przyglądali się praktycznie wyłącznie białkom rozpuszczalnym, właściwie nikt nie analizował białek zawartych w komórkach unoszących się w ślinie. Tymczasem mogą one świadczyć o rozwoju np. raka kolczystokomórkowego skóry w jamie ustnej (ang. oral squamous cell carcinoma).
Badacze z University of Minnesota oraz z University of Arkansas for Medical Sciences (USA) opracowali proteomiczną metodę trójstopniowego frakcjonowania peptydów (ang. three-step peptide fractionation), na które składają się następujące metody:
- preparatywne ogniskowanie izoelektryczne wykorzystujące elektroforezę natywną (ang. preparative IEF using free flow electrophoresis),
- chromatografia jonowymienna (ang. strong cation exchange step gradient chromatography),
- mikrokapilarna chromatografia cieczowa odwróconej fazy (ang. microcapillary reverse-phase liquid chromatography).
Za pomocą nowej metody, naukowcy przeanalizowali tysiąc próbek śliny pochodzących od pacjentów chorych na raka jamy ustnej i znaleźli wiele białek-markerów charakterystycznych dla nowotworów. Ku zaskoczeniu, badacze odkryli również obecność 30 białek pochodzenia bakteryjnego. Niektóre mikroby przyczyniają się również do powstawania nowotworu jamy ustnej.
hlbiotech
źródło: ScienceDaily.com
———————————
Oryginalna publikacja: Hongwei Xie et al., “Proteomics Analysis of Cells in Whole Saliva from Oral Cancer Patients via Value-added Three-dimensional Peptide Fractionation and Tandem Mass Spectrometry”, Molecular & Cellular Proteomics 7:486-498, 2008, Originally published In Press as doi:10.1074/mcp.M700146-MCP200
