Naukowcy z należącej do Applera Corporation firmy Applied Biosystems ogłosili sukces w kolejnym obniżeniu kosztów sekwencjonowania pełnego genomu człowieku do poziomu poniżej 100 tys. dolarów.

Poprzez zastosowanie nowoczesnej platformy sekwencjonowania następnej generacji, badaczom udało się nie tylko zanalizować 3 mld. par zasad za równowartość 60 tys. dolarów (koszty wszystkich komercyjnie dostępnych odczynników wykorzystanych w projekcie), ale również dostarczyć cennych informacji na temat wcześniej nieznanych a ważnych z medycznego punktu widzenia różnych polimorfizmów. Wszystkie sekwencje zostaną udostępnione badaczom za pośrednictwem bazy danych NCBI.

Przykład danych z sekwencjonowania DNA wygenerowanych
poprzez platformę SOLiD(TM) firmy Applied Biosystems
(źródło: Business Wire)

Dostępność tych danych pozwoli badaczom pracować nad dalszym zrozumieniem różnic genetycznych między ludźmi, które zakodowane są w DNA oraz opracowywać nowe terapie różnych chorób, jak i badać odpowiedź organizmu na stosowanie leków.

Naukowcy z Applied Biosystems resekwencjonowali próbki ludzkiego DNA wykorzystane w międzynarodowym Projekcie HapMap (International HapMap Project). Do analizy sekwencji wykorzystali oni platformę SOLiD(TM), która wygenerowała 36 gigabajtów danych w 7 cyklach systemu (nawet do 9 gigabajtów na cykl) i która tym samym jest obecnie najwydajniejszą na świecie platformą wysokoprzepustowego sekwencjonowania DNA

60 tys. dolarów to zaledwie niewielki ułamek kosztów, jakie wydano na przełomie XX i XXI wieku w Projekcie Poznania Genomu Człowieka (HGP), gdzie w poznanie sekwencji genomu zainwestowano ponad 300 mln. dolarów. W ten sposób sukces firmy Applied Biosystems wpisuje się w międzynarodową strategię firm biotechnologicznych doążących do obniżania kosztów sekwencjonowania pełnych genomów. Jeszcze niedawno mówiono o granicy 100 tys. dolarów. Dziś, gdy została ona przekroczona, gdy stosowane są coraz to nowocześniejsze, bardziej zaawansowane technologie, koszty te mogą wkrótce spaść do poziomu, przy którym każdy pacjent, każda osoba prywatna, będzie mogła sobie pozwolić na odszyfrowanie swojego genomu i zapisanie go na nośniku danych. Celem jest medycyna spersonalizowana, czyli taka, gdzie leczenie dostosowane będzie indywidualnie do aktywności genów.

hlbiotech

źródło: Appliedbiosystems.com

———————————
Przeczytaj również:
- 1000 Genomów - nowy międzynarodowy projekt
- Nowa technika sekwencjonowania DNA na mikroczipie drastycznie obniża czas i koszty eksperymentu
- Badanie własnego genomu za mniej niż 1000 dolarów - rewolucja na rynku testów genetycznych
- Co było pierwsze: genom kury czy jaja? - nowe spojrzenie na ewolucję genomu człowieka