Krakowski dostawca rozwiązań dla firm badawczo-rozwojowych, firma Selvita, wprowadza na rynek polską wersję systemu STARLIMS, która została przygotowana we współpracy ze specjalistami STARLIMS Corporation (Floryda, USA). STARLIMS to pierwszy najwyższej światowej klasy System Zarządzania Informacją Laboratoryjną LIMS (ang. Laboratory Information Management System) z całkowicie polskim interfejsem użytkownika.

więcej

Szósta edycja Poznańskiej Letniej Szkoły Bioinformatyki i Biologii Systemów (Poznan Summer School of Bioinformatics) odbędzie się w dniach 30 czerwca - 5 lipca 2008 r. na terenie kampusu Morasko Uniwersytetu im. A. Mickiewicza w Poznaniu. Kurs organizowany jest przez pracowników Wydziałów Biologii i obejmuje szeroki zakres zagadnień i technik związanych ze współczesną biologią obliczeniową.

więcej

150 bioinformatyków, w tym ponad 20 wykładowców z zagranicy (10 z USA i Kanady), bierze udział w rozpoczynającej się 24 kwietnia w Warszawie trzydniowej konferencji “Bioinformatics 2008″. Jej głównym organizatorem jest ICM - Interdyscyplinarne Centrum Modelowania Matematycznego i Komputerowego UW.

więcej

W tym miesiącu (kwiecień 2008) Protein Data Bank (PDB), umiejscowiony na Rutgers University (USA), po ponad 37 latach działalności zarchiwizował 50-ciotysięczną molekułę.

więcej

“Znajomość struktury przestrzennej biomolekuł pozwala na określenie mechanizmu działania białek i projektowanie m.in. enzymów oraz leków. Komputerowe, teoretyczne przewidywanie budowy układów biologicznych w oparciu o ich sekwencje może oszczędzić czas i koszty, jakie wiążą się z eksperymentem” - mówi dr Mariusz Makowski, chemik z Uniwersytetu Gdańskiego.

więcej

Określenie struktury nieznanych naturalnych związków chemicznych jest wolnym i bardzo kosztownym etapem wyszukiwania i rozwijania nowych leków. Sytuacja może się zmienić dzięki nowemu połączeniu protokołów eksperymentalnych i obliczeniowych rozwiniętych na Uniwersytecie Kalifornii i zaprezentowanych na konferencji RECOM2008 (Research in Computational Molecular Biology) w Singapurze.

więcej

Tylko nieliczni przechowuja w pamięci, gdzie ich przodkowie żyli 10 czy 20 pokoleń temu, jednak większość z nas może dowiedzieć się o swoim odległym dziedzictwie biologicznym z badań DNA. Nowe oprogramowanie do analiz genomowych stworzone przez informatyków ze Standford University (USA) skutecznie ujawniania pochodzenie danej osoby.

więcej

Naukowcy z USA odkryli nowy system kodowania informacji cyfrowej za pomocą DNA. Nie polega on wcale na kolejnej wersji stosowanej na razie metodzie wykorzystującej sekwencje nukleotydów, lecz na długości fragmentów restrykcyjnych materiału genetycznego uzyskanych przez potraktowanie DNA enzymami restrykcyjnymi. W ten sposób zbędne staje się stosowanie kosztownej techniki sekwencjonowania.

więcej

Naukowcy z Instytutu Bioinformatyki stanu Virginia oraz z Wydziału Informatyki na Virginia Tech (USA) są autorami pierwszej analizy interakcji białek ludzkich z wirusowymi i białkami innych patogenów. Badacze sprawdzili wszystkie publicznie dostępne dane dla 190 różnych patogenów, co odpowiada ponad 10 tysiącom oddziaływań między białkami ludzkimi i patogennymi.

więcej

Od czasów Darwina toczy się wśród naukowców gorąca dyskusja, czy przed milionami lat, na długo zanim na Ziemi pojawiły się najbardziej prymitywne organizmy żywe, białka mogły powstawać z aminokwasów w sposób sponatniczny. Hipotezę tą postanowił sprawdzić zespół niemieckich badaczy, jednak nie przy użyciu kombinacji związków chemicznych i parametrów fizycznych, ale wyłącznie narzędzi bioinformatycznych, czyli in silico!

więcej

Naukowcy z Johns Hopkins Institute of Genetic Medicine (USA) opracowali największe jak dotąd źródło informacji eksperymentalnych na temat ludzkich białek. Na łamach czasopisma “Nature Biotechnology” opisano jak badacze z całego świata mogą uzyskać dostęp do tych danych, aby przyspieszyć swoje własne projekty i nie powielać wykonanych już analiz.

więcej

Identyfikacja genów odpowiedzialnych za choroby będzie dużo prostsza i szybsza dzięki wykorzystaniu do tego celu nowej technologii opartej na modelach sieci genów stworzonej przez naukowców z Uniwersytetu w Texasie (USA).

więcej

Nowe narzędzie komputerowe stworzone przez naukowców z University of Texas Southwestern Medical Center (USA) automatycznie i bardzo szybko porównuje wiele dokumentów pod względem ich podobieństwa. Takie podejście ułatwi przeszukiwania literatury jak również da edytorom czasopism naukowych narzędzie do odrzucania publikacji podejrzewanych o plagiat.

więcej

U grzybów trudno mówić o osobnikach męskich i żeńskich, a jednak istnieją wyraźne różnice między osobnikami o różnej “płci”. Nowe odkrycie naukowców z Duke University Medical Center opublikowane na łamach “Nature” dowodzi, że niektóre z grzybów, które są ewolucyjnie najstarsze stanowią ważne wskazówki w wyjaśnieniu jak ewoluowały płcie u zwierząt wyższych, łącznie z odległymi ewolucyjnie ludźmi.

więcej

Połączenie tradycyjnych technik eksperymentalnych biologii molekularnej z metodami obliczeniowymi opartymi na sztucznej inteligencji zaproponowała grupa naukowców z Ruder Boškovic Instititute oraz z Faculty of Natural Sciences and Mathematics z Zagrzebia (Chorwacja) jako nowe podejście do produkcji charakterystycznych “odcisków palców” (ang. fingerprint) białek pochodzących z różnych tkanek. Podejście może w przyszłości doprowadzić do rozwoju bardzo nowoczesnych metod diagnostyki medycznej.

więcej