Niewielka grupa naukowców ogłosiła niezwykle ambitny plan skatalogowania i opisania wszystkich białek ludzkiego organizmu. W ten sposób narodził się Projekt Poznania Proteomu Człowieka (ang. Human Proteome Project). Koszty tego przedsięwzięcia są wstępnie szacowane na miliard dolarów, a czas jego realizacji na przynajmniej dekadę. Powstaje pytanie, czy badacze są w stanie zgromadzić tyle środków.

więcej

Biofizykom z Politechniki w Monachium i Uniwersytetu w Bayreuth (Niemcy) udało się odtworzyć w laboratorium naturalny proces syntezy pajęczych nici. Dzięki temu możliwe będzie poznanie właściwości fizycznych i chemicznych tych naturalnych włókien o ogromnej wytrzymałości. Pracę niemieckich bioinżynierów publikuje “PNAS“.

więcej

W tym miesiącu (kwiecień 2008) Protein Data Bank (PDB), umiejscowiony na Rutgers University (USA), po ponad 37 latach działalności zarchiwizował 50-ciotysięczną molekułę.

więcej

“Znajomość struktury przestrzennej biomolekuł pozwala na określenie mechanizmu działania białek i projektowanie m.in. enzymów oraz leków. Komputerowe, teoretyczne przewidywanie budowy układów biologicznych w oparciu o ich sekwencje może oszczędzić czas i koszty, jakie wiążą się z eksperymentem” - mówi dr Mariusz Makowski, chemik z Uniwersytetu Gdańskiego.

więcej

Stworzenie w probówce enzymów, których zadaniem jest nie występująca w przyrodzie kataliza reakcji chemicznych, jest wielkim wyzwaniem dla inżynierów białek. Naukowcom z University of Washington w Seattle, University of California w Los Angeles (USA) oraz z Weizmann Institute of Science (Izrael) udało się zaprojektować przy pomocy narzędzi bioinformatycznych, a następnie zsyntetyzować in vitro funkcjonalne enzymy - informuje “Nature“.

więcej

Na łamach “Nature Methods” opublikowana została praca amerykańskich naukowców ze Structural Genomics Consortium poświęcona nowej technice krystalizacji białek. Ułatwi ona znacznie eksperymenty na strukturach tych cząsteczek.

więcej

Duży niepokój budzą infekcje bakterii odpornych na leki. Dlatego wiele wysiłku naukowcy poświęcają na znalezienie nowych klas antybiotyków. Badacze z USA są o krok od osiągnięcia tego celu. Na łamach czasopisma “PNAS” jako klasę nowych leków sugerują peptoidy, czyli cząsteczki zaprojektowane przez człowieka, o wysokim stopniu podobieństwa do naturalnych ludzkich białek odgrywających kluczowe funkcje w układzie immunologicznym. Peptoidy mogą stać się zupełnie nową klasą antybiotyków o bardzo istotnym znaczeniu.

więcej

Naukowcy z USA opracowali innowacyjną metodę pozwalającą wydzielić z ludzkiej śliny i zbadać wszystkie białka - i to nie tylko te rozpuszczalne - donosi czasopismo “Molecular And Cellular Proteomics“.

więcej

Na łamach “Journal of Biology” brytyjscy naukowcy opisują innowacyjny mikroczip z rodzaju “laboratorium na czipie” wykorzystujący niewielkich rozmiarów elektrody, dzięki którym możliwe będzie wykrywanie białek świadczących o różnych schorzeniach jedynie na podstawie zawartości kropli krwi lub moczu.

więcej

Naukowcy z Instytutu Bioinformatyki stanu Virginia oraz z Wydziału Informatyki na Virginia Tech (USA) są autorami pierwszej analizy interakcji białek ludzkich z wirusowymi i białkami innych patogenów. Badacze sprawdzili wszystkie publicznie dostępne dane dla 190 różnych patogenów, co odpowiada ponad 10 tysiącom oddziaływań między białkami ludzkimi i patogennymi.

więcej

Aby cząsteczki konieczne do przeżycia organizmu mogły poprawnie pełnić swoje funkcje, muszą najpierw przyjąć określony kształt w procesie nazywanym zwijaniem. Takie ukształtowane cząsteczki mogą już wchodzić w interakcje z innymi molekułami, aby przyspieszać przebieg reakcji chemicznych lub kontrolować ekspresję genów włączając bądź je wyłączając.

więcej

Naukowcy z Johns Hopkins Institute of Genetic Medicine (USA) opracowali największe jak dotąd źródło informacji eksperymentalnych na temat ludzkich białek. Na łamach czasopisma “Nature Biotechnology” opisano jak badacze z całego świata mogą uzyskać dostęp do tych danych, aby przyspieszyć swoje własne projekty i nie powielać wykonanych już analiz.

więcej

Połączenie tradycyjnych technik eksperymentalnych biologii molekularnej z metodami obliczeniowymi opartymi na sztucznej inteligencji zaproponowała grupa naukowców z Ruder Boškovic Instititute oraz z Faculty of Natural Sciences and Mathematics z Zagrzebia (Chorwacja) jako nowe podejście do produkcji charakterystycznych “odcisków palców” (ang. fingerprint) białek pochodzących z różnych tkanek. Podejście może w przyszłości doprowadzić do rozwoju bardzo nowoczesnych metod diagnostyki medycznej.

więcej

Wczesne wykrycie działań niepożądanych leku jeszcze zanim będzie on testowany na ludziach ma kluczowe znaczenie w rozwoju nowych terapii. Naukowcy z Uniwersytetu Kalifornijskiego w San Diego (USA) rozwinęli nową technikę wykorzystującą modelowanie komputerowe do identyfikacji potencjalnych efektów ubocznych działania leków. Badacze wykorzystali swoją metodę do analizy klasy leków zawierających tamoxifen, najczęściej stosowanych w leczeniu raka piersi. Wyniki badań opublikowano na łamach “PLoS Computational Biology.”

więcej

Rosnące zapotrzebowanie na różnej maści białka produkowane w coraz krótszym czasie stanowi nowe wyzwanie dla laboratoriów na całym świecie, które muszą poszukiwać coraz wydajniejszych systemów ekspresji białek oraz zautomatyzowanych rozwiązań. Problem ten stanowi główną siłę napędową rozwoju rynku produktów do oczyszczania białek w Europie, na którym dochody z tego tytułu szacowane są na poziomie 170 mln. dolarów w 2007 roku.

więcej